Biobank-based Evaluation of New Cervical Screening Tests
- Reference number
- RB13-0011
- Start and end dates
- 150101-220331
- Amount granted
- 31 821 746 SEK
- Administrative organization
- Karolinska Institutet
- Research area
- Life Sciences
Summary
We propose a novel, faster, more reliable, and less expensive method for the evaluation of clinically useful biomarkers, through exploitation of the Swedish register and biobank infrastructure. A state-of-the-science biobank, collected within a population-based cervical screening program, will be followed for clinical outcomes and original screening test results through linkages with comprehensive registries. This study base will be used to evaluate both commercially available biomarkers, and biomarkers under clinical development. In addition, we will perform a comprehensive new analysis of genetic markers, RNA transcription and key regulatory proteins. We will compare whether the omics-derived biomarkers contribute any additional predictive ability over and above the performance of the biomarkers that are on, or close to, market. With this approach we will establish whether any new biomarker, or combinations of such, are superior to the currently used best practice in cervical screening (molecular virus testing (HPV-test) with secondary screening of HPV-positive women using cytology triage). The project is nested within the organized screening program and has a defined implementation plan on how to introduce the best biomarkers in the screening program. Our goal is to tailor screening intensity to each individual according to her biomarker-determined risk of disease – thereby improving public health as well as furthering Swedish competiveness in biomarker research.
Popular science description
Vårt projekt syftar till att utveckla ett nytt, snabbare, säkrare och billigare sätt att utvärdera om ett nytt test (biomarkör) skulle kunna förbättra ett kliniskt provtagningsprogram. Som modell använder vi den gynekologiska cellprovskontrollen, ett organiserat program som erbjuds alla svenska kvinnor mellan 23-60 års ålder och som medfört en kraftigt minskad sjuklighet i livmoderhalscancer. På senare år har två stora förändringar införts i detta program. Dels har man börjat använda ett virus-test (HPV-test) istället för att analysera cellprovet genom att titta på cellernas utseende; dels tas provet i en förvaringsvätska som medger att provet kan sparas i många år och ändå senare användas för att analysera både DNA, RNA, proteiner och celler. Utvärdering av biomarkörer görs idag oftast i olika studier som är väldigt kostsamma och där det tar mycket lång tid att följa upp patienterna. Dessutom utvärderas olika tester i olika material och kan då inte jämföras på ett bra sätt. Genom att ta de prover som sparats (i biobanker), och till dem koppla information om vilka kvinnor som fått sjukdom flera år efteråt, kan vi utvärdera hur olika tester fungerar även på lång sikt. Detta är den viktigaste faktorn för att avgöra om ett nytt test medför en förbättrad kostnadseffektivitet (det vill säga huruvida man inte behöver ta testet lika ofta). Vi kommer att utvärdera ett flertal tester som redan finns på marknaden, samtidigt som vi även kommer att leta efter nya biomarkörer (såsom uttryck av gener eller proteiner). Eftersom alla biomarkörer utvärderas med samma prover kan vi avgöra vilka biomarkörer som tillför något mer än andra; och avgöra vilken/vilka som skulle innebära den största förbättringen för cellprovskontrollen. Sverige har internationellt en unik fördel för utveckling av biomarkörer eftersom vi har tillgång till heltäckande biobanker och registerdata. Genom detta projekt hoppas vi dels att kunna förbättra kvinnohälsan, dels visa på de strategiska möjligheter som fördelarna i vår svenska forskningsinfrastruktur medger. Därigenom stärker vi både svensk konkurrenskraft och folkhälsan i allmänhet.