Systems biology of malignant blood disorders
- Reference number
- ICA08-0057
- Start and end dates
- 090910-131231
- Amount granted
- 3 000 000 SEK
- Administrative organization
- Lund University
- Research area
- Life Sciences
Summary
This grant will be used to assemble an independent research group at Lund University. The aim of this group will be to understand malignant blood disorders at a cellular systems level: that is, how molecular components of blood cells function/malfunction on a broader scale in diseases like leukemia. Potentially, systems-scale models can explain disease mechanisms and enable prediction of new therapeutic strategies. Working in collaboration with researchers at the Broad Institute and University of Toronto, we will address two key problems in hematology: (a) to understand leukemic stem cells and (b) to understand ribosomal disorders. As a basis for our work, we will use unique systems-scale data acquired by next-generation sequencing, high-throughput screening, and various microarray techniques. We will then apply novel computational approaches coupled with directed validation experiments to elucidate how leukemic stem cells drive acute myeloid leukemia and how ribosomal dysfunction contributes to cancer causation. Our proposal will (a) produce new methods to translate complex genomics data into predictive/mechanistic disease models, (b) increase our understanding of blood disorders, especially acute myeloid leukemia and ribosomal disorders, (c) allow the formation of a research group with a unique profile in Lund, (d) increase the use of leading-edge genomics technology in Sweden, and (e) strengthen Sweden's connections with world-leading centers of post-genomic science.
Popular science description
Människans sjukdomar kan nu kartläggas i allt högre detalj med förfinad molekylärbiologisk (s k genomisk) analysteknik. Med sådan teknik går det att analysera tusentals cellulär molekyler på ett bräde, och det börjar finnas förutsättningar för att beskriva cellulära sjukdomsprocesser i sin helhet, i "systemperspektiv". Detta projekt syftar till att utveckla nya metoder för att karaterisera blodsjukdomar utifrån komplex genomisk information. Dessa metoder kommer vi att utnyttja för att detaljstudera två viktiga frågor inom klinisk hematologi (läran om blodsjukdomar): (1) hur fungerar den s k leukemiska stamcellen? d v s den celltyp som underblåser leukemi (blodcancer) och den celltyp som måste behandlas bort för att nå långvarig bot. Här syftar våra studier till att hitta enskilda gener och och reglermekanismer mellan gener som, på längre sikt, kan utnyttjas för förbättrad diagnostik och behandling. (2) hur fungerar s k ribosomala sjukdomar? På senare tid har man upptäckt att mutationer i ribosomerna, cellens proteinfabrik, kan vara involverade i tumörutveckling. Våra studier syftar till kartlägga förekomsten och betydelsen av ribosomala mutationer vid blodsjukdomar. Projektet kommer att förläggas till Lunds Universitet och bedrivas i samarbete med forskare vid Broad Institute (del av Harvard University och Massachusetts Institute of Technology, USA) och University of Toronto (Canada). Projektet kan leda till förbättrade metoder för att omsätta komplexa genomiska data till system-modeller av sjukdom och, på längre sikt, till förbättrade metoder för att diagnostisera och behandla maligna blodsjukdomar.