4D Chromatin dynamics in malignant blood cell development.
- Reference number
- SAB19-0013
- Start and end dates
- 200101-231230
- Amount granted
- 1 322 851 SEK
- Administrative organization
- Lund University
- Research area
- Life Sciences
Summary
Despite that intense research has allowed for dramatic improvement in cancer care and survival, malignant disease yearly claim the life of over 20 000 persons in Sweden. While modern DNA sequencing technology has allowed for the identification genetic abnormalities linked to malignant transformation, our overall understanding for how these mutations cause cancer remains limited. In order to develop my research program to better understand the biological impact of genetic alterations in cancer I intend to conduct a sabbatical in Dr Murres laboratory to learn the latest approaches for the analysis of chromatin dynamics. Dr Murre has been a pioneer in the exploration of this research area developing technical approaches to explore changes in 3D configuration as well as the timing of events to generate data in 4D. The project will be based on the introduction of DNA binding sites for proteins not normally expressed in eukaryotic cells, into putative regulatory regions. The introduction of these binding sites allows for selective targeting of ectopically expressed fluorescent marker proteins to defined elements. This analysis is combined with RNA-FISH analysis to identify newly produced RNA in the nucleus to generate 4D data. This knowledge I will use to develop a translational research program to improve cancer treatment and diagnosis. This would provide a most substantial strategic value for Sweden out of technical and medical but also socioeconomic perspective
Popular science description
Även om intensiv forskning har möjliggjort dramatiska förbättringar inom cancervården avlider årligen över 20 000 människor som en direkt konsekvens av sin sjukdom. Trots att modern teknologi har genererat stora mängder information rörande genetiska förändringar som kan länkas till cancer, är vår förståelse av länken mellan mutationer och deras förmåga att orsaka cancer begränsad. En av de orsaker vi vet ligger bakom cancer är förändringar i våra kromosomers funktion. För att utveckla mitt forskningsprogram avser jag nu genomföra en forskningsvistelse i Dr Cornelis Murres laboratorium på University of California i San Diego för att lära mig de senaste teknikerna för studier av arvsmassans rörelser i tid och rum (4D). Jag kommer att arbeta med komplexa modell system där kromosomernas rörelse i cellkärnan kan studeras med mikroskopi. Genom att även studera tidsaspekterna av dessa rörelser kan man skapa en 4-dimensionell mapp av kromosomernas rörelser. Jag vill använda denna kunskap för att bygga upp ett translationellt forsknings program i Sverige med målet att utveckla nya metoder för diagnos och behandling av cancer vilket kan få en stor strategisk betydelse för svensk forskning.