Single cell microRNA profiling of breast cancer
- Reference number
- ID14-0075
- Start and end dates
- 150101-171231
- Amount granted
- 1 250 000 SEK
- Administrative organization
- Göteborg University
- Research area
- Life Sciences
Summary
Based on novel proprietary technology for the detection of microRNAs (miRNA), which has distinct advantages to current methods, we will develop assays for selected miRNA targets of relevance for breast cancer. Combined with available assays for selected messenger RNAs (mRNA) a workflow for the combined profiling of miRNAs and mRNAs will be developed, with a sensitivity sufficient to profile single cells. This will be the first platform of this kind in the world. The workflow will be validated on breast cancer cells in unique tumor models and expression profiles signatory for different cancer cells will be identified, with focus on cancer stem like cells, which are thought to be the initiators of malignant growth and most resistant to treatment. This platform will after relevant patent protection offered as base for the development of companion diagnostics in collaboration with pharmaceutical companies. Products for miRNA analysis in research applications will be offered by the industry partner.
Popular science description
Tumörer är heterogena och består av flera olika typer av celler. För att förbättra nuvarande diagnostik och behandlingar krävs molekylär förståelse av de biologiska processer som påverkar olika typer av tumörceller. En viktig grupp av molekyler är microRNA (miRNA) vilka reglerar de flesta grundläggande processerna som styr cellernas funktion. För att i detalj förstå tumörheterogeniteten behöver man analysera varje cell för sig. Nuvarande metoder för att mäta miRNA har alla en rad olika problem, vilket gör att dom inte kan användas för encellsanalyser på ett optimalt sätt. Kring ny patenterad teknik fördetektion av miRNA, som har distinkta fördelar gentemot befintliga tekniker, ska vi utveckla tester för utvalda miRNA av relevans för bröstcancer. Kombinerat med existerande tester för messenger RNA (mRNA) tar vi fram ett arbetsflöde för kombinerad profilering av miRNA och mRNA med en känslighet tillräcklig för att karaktärisera enstaka celler. Detta blir den första plattformen av sitt slag i världen. Arbetsflödet kommer valideras för bröstcancerceller i avancerade tumörmodeller och uttrycksprofiler karakteristiska för olika tumörceller kommer bestämmas, med fokus på cancerstamceller, som antas initiera elakartad tillväxt och vara mest resistenta mot behandling. Relevanta aspekter av plattformen kommer patentskyddas och erbjudas som grund för samarbete till ledande läkemedelsföretag. Produkter för analys av miRNA inom forskning kommer erbjudas av industripartnern.