Technologies for high throughput single cell multi-omics
- Reference number
- APR20-0049
- Project leader
- Fredriksson, Simon
- Start and end dates
- 210501-231231
- Amount granted
- 0 SEK
- Administrative organization
- KTH - Royal Institute of Technology
- Research area
- Life Science Technology
Summary
This research and technology development project between Pixelgen and KTH main objective is to produce a biomolecular assay method with unprecedented throughput for analyses of many single-cell samples for many targets of both RNA and proteins in each cell. The first 2 years will comprise a technology proof-of-concept stage where the method is designed and optimized for 1000 RNA targets and 100 proteins handling 100 samples per day. Currently no such technology exists capable of both proteins and RNA locally in cells. As the project progresses, the capacity of the technique will be increased and implemented into the various Cell Atlas projects at KTH using their expertise in selecting the appropriate basic scientific questions to address with this novel technology. The expected results will be an assay method product available from Pixelgen in the rapidly growing field of single cell multi-omics analyses. These products will be exported globally strengthening the competitiveness of Swedish biotechnology industry. And at KTH, novel insights and understanding of single cell biology will be published in academic journals, thus furthering the Swedish leading role in basic single-cell proteomics research. KTH graduate students will be trained by the applicant in technology development, intellectual property, and research commercialization/entrepreneurship using his biotech industry experience thereby cross-fertilizing the academic and industrial sectors.
Popular science description
Livets beståndsdelar har historiskt behövt analyseras med allt högre upplösning för att föra vårt biologiska och medicinska kunnande framåt. Tidigare analyserades grupper av celler tex en tumör tillsammans, nu mera bryts tumören ned i olika cell-typer för analys av dessa enstaka celler. Detta har lett forskarna till nya insikter om tumörutveckling och möjliga behandlingar. Denna progression med allt högre upplösning kommer att fortgå ända ner till analys av de individuella cellernas beståndsdelar och deras positioner i cellerna. Utveckling av nya analytiska verktyg för forskningsändamål kräver samordning mellan industri och akademi. Därmed kan man bäst anpassa de produkt verktyg som utvecklas till att passa forskningens senaste och framtida problemställningar. Projektet kommer att samverka mellan industri och akademi för att korsbefrukta dessa båda parter. Akademin får därmed insikter och kunskap om industriell utveckling av life science produkter och entrepreneurskap som helhet. Medans industriparten får tillgång till forskningsfrontens frågeställningar och problemställningar att lösa med förbättrade och helt nya analytiska teknologier.