Hoppa till innehåll
EN In english

Genome och proteome analys av bakteriell virulence

Diarienummer
FFL09-0015
Start- och slutdatum
110101-161231
Beviljat belopp
9 634 749 kr
Förvaltande organisation
Lund University
Forskningsområde
Livsvetenskaperna

Summary

Bacterial infections represent a major and global health problem, which is further aggravated by the rapid and ongoing increase of antibiotic resistance. The identification of novel preventive, diagnostic and therapeutic opportunities is a considerable health priority. The main goal of my research is to establish a generic approach to describe how different bacteria develop virulent traits to support the development of novel therapies. I have recently published a novel proteomics technique, significantly beyond current state of the art, that allow the identification and absolute quantification all the predicted open reading frames in a bacterial genome. To investigate the acquisition of pathogenic characteristics I intend to infect mice with non-virulent Streptococcus pyogenes bacteria and isolate the bacteria from these animals until large differences in virulence have been acquired. Using state-of the art genomics and novel proteomics analysis of the original, intermediate and final strains, I will create a comprehensive model of how bacteria acquire virulence. Proteins involved in the virulence process will be analyzed in vitro and in vivo and serve as targets for therapeutic intervention. My research program will elucidate the molecular mechanisms used by S. pyogenes to circumvent host defense strategies but the approach is generic and extendable to other pathogens. My findings will facilitate the search for therapeutic targets also in other bacterial infections.

Populärvetenskaplig beskrivning

Bakteriella infektioner utgör idag ett stort och globalt hälsoproblem. Den ökande resistensen mot antibiotika är alarmerade och det finns idag ett stort behov av att hitta ny metoder för att karakterisera och förhindra den den pågende utvecklingen. Det är sedan tidigare känt att vissa bakteriestammar är ofta associerade med mer allvarliga typer av bakteriella sjukdomar som till exemple sepsis. Målsättningen i det här projktet är att utveckla en metod som kan förklara varför vissa bakteriestammar är farliga än andra. I första hand kommer grupp A streptococcer studeras som idag är ett stort medicinskt problem, men metoden kommer också att modifieras för att studera andra typer av bakterier. Förhoppningen är att kunna förutse vilka patienter som riskerar att få de allvarligare typerna av bakteriella sjukdomar för att i kunna ge dem rätt vård snabbare. I förlägningen är målsättningen att använda metoden för att identifiera nya måltavlor för nya läkemedel och vaccin.