Dataanalys för detektion av läkemedelseffekter

Diarienummer: IIS11-0053
Start- och slutdatum: 120101-170331
Beviljat belopp: 18 822 680 kr
Förvaltande organisation: Stockholm University
Forskningsområde: Informations-, kommunikations- och systemteknik

Summary

För att upptäcka läkemedelseffekter på olika delpopulationer krävs normalt ett mycket stort antal fall, något som inte finns tillgängligt under tidiga kliniska försök. Förutom ett ökande antal modeller och databaser inom läkemedelsindustrin, så växer den mängd data som kan vara av stort värde för sådana analyser snabbt även utanför läkemedelsindustrin, både i form av elektroniska patientjournaler och läkemedelsregister och i form av globalt insamlade biverkningsrapporter. Genom att koppla ihop olika informationskällor för läkemedelsbiverkningar kan kvaliteten på beslutsfattandet inom både läkemedelsindustrin och hälso- och sjukvården förbättras. Det är dock en stor utmaning att analysera dessa typer av massiva, heterogena och ständigt växande datamängder. Det huvudsakliga målet med detta projekt är att utveckla tekniker och verktyg för att stödja beslutsfattande och upptäckt av läkemedelseffekter genom att analysera patientjournaler, läkemedelsregister, biverkningsrapporter och kemiska data i form av både strukturerad och ostrukturerad (fri text) data. Projektet kommer att bidra med nya metoder för data mining och klinisk text mining och utveckla en plattform för storskalig analys av massiva, heterogena och ständigt växande datamängder. Projektet kommer att som pilotfall studera effekter hos läkemedel mot hjärtsjukdomar, vilka hör till de stora välfärdsjukdomarna.

Populärvetenskaplig beskrivning

För att upptäcka vilka effekter ett visst läkemedel har på olika grupper av patienter krävs betydligt fler fall än vad som normalt finns tillgängligt under utvecklingsfasen av läkemedlet. Förutom den information som finns tillgänglig inom läkemedelsindustrin, så växer mängden data även snabbt utanför denna, både i form av elektroniska patientjournaler och läkemedelsregister och i form av biverkningsrapporter som samlas in från hela världen. Denna information kan vara mycket värdefull för att få svar på om ett läkemedel som är under utveckling kan förväntas få oönskade biverkningar. Genom att koppla ihop olika informationskällor för läkemedelsbiverkningar kan kvaliteten på beslutsfattandet förbättras, inte bara i läkemedelsindustrin utan också inom hälso- och sjukvården. Det är dock en stor utmaning att analysera dessa typer av massiva, olikartade och ständigt växande datamängder. Det huvudsakliga målet med projektet är att utveckla metoder och programvara för att stödja forskare och sjukvårdspersonal med att upptäcka läkemedelseffekter genom att analysera patientjournaler, läkemedelsregister, biverkningsrapporter och kemiska data i olika former. Projektet kommer att bidra med nya metoder för data och textanalys och utveckla en programvara för storskalig analys av massiva och ständigt växande datamängder. Projektet kommer som pilotfall att studera effekter hos läkemedel mot hjärtsjukdomar, vilka hör till de stora välfärdsjukdomarna.