Spatiell upplöst systembiologisk analys
- Diarienummer
- ID18-0094
- Start- och slutdatum
- 190101-241231
- Beviljat belopp
- 2 500 000 kr
- Förvaltande organisation
- KTH - Royal Institute of Technology
- Forskningsområde
- Livsvetenskaperna
Summary
Målet med detta projekt är att utveckla och tillämpa spatiell transkriptomik i lungan för att generera spatiell upplöst mekanistiskt data avseende det terapeutiska index (på målfarmakologi samt molekylär / cellulär toxikologi) av föreningar som är avsedda för behandling av lungsjukdomar. Arbetsplanen består av tre uppgifter 1. Etablering av spatiell transkriptomik i lunga 2. Bioinformatisk programmering 3. Mekanistisk förståelse Etablering av ST-teknik i lunga skulle ge direkt inblick i molekylära mekanismer och signalvägar som utlöses efter exponering och skulle ge ovärderlig data avseende 1, cellspecifika molekylära mekanismer som ligger till grund för farmakologisk effekt och 2, hur observerad toxikologi avser farmakologin och / eller off-target-mekanismer. Förståelsen av sådana signalvägar förväntas accelerera utformningen och utvecklingen av säkra nya terapeutiska mediciner för lungsjukdomar, samt tillhandahålla förståelse om det kliniska nyttjandet av kandidatdroger.
Populärvetenskaplig beskrivning
I detta industridoktorand projekt ämnar vi tillämpa och vidareutveckla en ny kraftfull teknologi, Spatial Transcriptomics, för att studera globalt genuttryck hos behandlad lungvävnad. Toxiska effekter orsakade av läkemedel är ett av de största hindren inom läkemedelsindustrin för att nå ut med annars lovande kandidatläkemedel till patienter. Genom ökad förståelse av läkemedlets effekter är det dock möjligt att identifiera och åtgärda toxiska föreningar i ett tidigt skeende och således effektivisera utvecklingen av säkra läkemedel. På grund av tidigare tekniska begränsningar är dock kunskapen kring de effekter inhalerbara läkemedel har på lungvävnad mycket begränsad. Därmed vill vi kartlägga detta outforskade område för att öka förståelsen av de molekylära mekanismer som styr vävnadens svar vid exponering av inhalerade läkemedel på ett systematiskt vis, något som utan denna nya teknologi inte tidigare varit möjlig. Tillämpning av Spatial Transcriptomics i detta sammanhang skulle härmed ge upphov till helt unik data samt även bli startskottet på ett samarbete mellan teknologins utvecklare på SciLifeLab och experter inom läkemedelsutveckling på AstraZeneca, vilket är av stor strategisk vikt för båda parter.