värd-patogeninteraktioner: ETEC och V.cholerae
- Diarienummer
- SB12-0072
- Start- och slutdatum
- 130801-190630
- Beviljat belopp
- 24 999 858 kr
- Förvaltande organisation
- Göteborg University
- Forskningsområde
- Livsvetenskaperna
Summary
Kolerabakterier, Vibrio cholerae, och enterotoxinbildande E. coli-bakterier (ETEC) orsakar nära hälften av all infektionsorsakad diarré globalt. Detta projekt bygger på en unik kunskap om dessa patogener som byggts upp under mer än 40 år i Göteborg. Vi avser nu i ett internationellt samarbete ta den infektionsbiologiska forskningen om ETEC och V. cholerae till nästa nivå. Detta kommer att ske genom: 1) fylogenetisk analys av helgenompolymorfismer hos V. cholerae och ETEC för att identifiera evolutionära mekanismer, spridning och virulens. Separat kommer genpolymorfismer analyseras hos kolerasjuka jämfört med friska individer i en stor koleravaccinfältstudie i Indien samt från svenskar och indier/bangladesher som svarat starkt resp svagt på kolera- resp ETEC-vaccination; 2) analys av transkriptomet i bakterie och tarm under infektion i en väldefinierad musmodell m.h.a. RNA-seq (Illumina) och bioinformatik. Vi vill studera hur värdens genuttryck i olika delar av tarmen påverkas under infektion samt omvänt hur bakteriernas genuttryck förändras av värdfaktorer; 3) fortsatt utveckling av nya vacciner mot V. cholerae och ETEC samt mukosala adjuvans i samarbete med svenska vaccinföretag. Projektet har stor betydelse för infektionsbiologi och global hälsa och målsättningen är att vi också framgent ska ha en internationellt ledande plats inom såväl grundläggande som tillämpad infektionsbiologisk forskning och vaccinutveckling.
Populärvetenskaplig beskrivning
Infektionsbiologiska studier och vaccinutveckling vid kolera och ETEC-diarré Infektion i tarmen med kolerabakterier eller s.k. enterotoxinbildande E. coli-bakterier (ETEC) orsakar nära 500 miljoner sjukdoms- och 300-500 000 dödsfall årligen. Projektets målsättning är att fortsatt ha en internationellt ledande plats inom såväl grundläggande som tillämpad infektionsbiologisk forskning om kolera och ETEC-orsakad diarré och vaccinutveckling mot dessa sjukdomar. Forskningen är inriktad på: A."Molekylär-genomisk forskning om förändringar hos kolera- och ETEC-bakterier som kan påverka smittspridning och sjukdomsegenskaper. En ny typ av kolerabakterier har nyligen ersatt den gamla El Tor-typen i hela världen. Den nya typen verkar vara mer aggressiv vilket kan förklara de stora epidemier som setts i Haiti och i Afrika under senare år. Vi undersöker i ett internationellt samarbete sådana hybridstammars genetiska förändringar, förändringar i virulens, och ev. skillnader för vaccinskydd. Vi ska på likartat sätt undersöka ETEC-bakterier från olika håll i världen. B."Molekylärt ”cross-talk” mellan bakterier och tarm. Vid en infektion påverkar inte bara den sjukdomsalstrande mikroorganismen den infekterade individen (”värden”) utan värden kan också påverka mikroorganismen. Vi ska i en musmodell studera hur värdens genuttryck i olika delar av tarmen påverkas under kolera- och ETEC-infektion samt hur bakteriernas genuttryck för t ex bildning av olika sjukdomsframkallande faktorer förändras. Vi ska också studera hur olika värdfaktorer, t ex antikroppar, identifierade tarmreceptorsubstanser och faktorer i galla påverkar genuttryck hos kolera- och ETEC-bakterier. C."C. Molekylär-genomisk forskning för att identifiera gener hos människa som påverkar mottaglighet och vaccinsvar mot kolera och ETEC. Vi har i samarbete med indiska forskare i en stor vaccinfältprövning i Kolkata möjlighet att analysera genvariation mellan individer som utvecklar resp. inte utvecklar kolera under 3 års uppföljning. D."Fortsatt utveckling av drickbara vacciner. Vi har tidigare utvecklat ett drickbart vaccin mot kolera (Dukoral®). Fortsatt arbete i samverkan med svenska vaccin-/bioteknikföretag är inriktat på: (1) Framtagning av ett förenklat oralt koleravaccin med ökad effektivitet; (2) utveckling och klinisk utprövning av vaccin mot ETEC-diarré; och (3) framtagning av immunförstärkande komponenter (adjuvans) för dessa och andra slemhinnevacciner.