Nya metoder för snabb upptäckt av hot mot våra skogar
- Diarienummer
- UKR24-0026
- Projektledare
- Matsiakh, Iryna
- Start- och slutdatum
- 241231-251230
- Beviljat belopp
- 1 000 000 kr
- Förvaltande organisation
- Swedish University of Agricultural Sciences
- Forskningsområde
- Livsvetenskaperna
Summary
Idag lider den svenska skogen av flera skogshälsoproblem orsakade av insekter och svampar, som orsakar stora ekonomiska och ekologiska effekter på grund av förluster i virkes tillväxt och avdöende av träd. Tall – en av de ekonomiskt viktigaste trädarterna i Sverige – hotas idag av flera nya eller utvecklingen av inhemska svampsjukdomar. Situationen väntas bli ännu värre av klimatförändringarna. Bristen på verktyg för att snabbt upptäcka och identifiera nya och framväxande hot när de dyker upp innebär att tidsfönstret för att reagera och genomföra begränsningsåtgärder som kan minska förlusterna ofta kommer för sent. Eskalerande skador i skogen kommer att orsaka instabilitet i råvaru för sörjningen förden växande bioindustrin som är viktig för Sveriges omställning till en fossilfri ekonomi. Syftet med projektet är att utveckla banbrytande Loop-mediated isothermal amplification (LAMP)-baserade diagnostiska analysmetoder för snabb och tidig upptäckt av tallpatogener som i nuläget är relevanta för Sverige. Analysmetoderna kommer att utvecklas och valideras för att skapa en enkel och bärbar lösning så att skogsskötare och andra kan använda dem för att upptäcka patogener långt ut i skogen. Med förbättrade verktyg för snabb upptäckt och övervakning kan vi förbättra skogens hälsotillstånd och skydda vår livsviktiga virkesresurs, biologiska mångfald och övriga ekosystemtjänster.
Populärvetenskaplig beskrivning
Scots pine (‘tall’ in Swedish) and lodgepole pine ('contortatall) are among the important commercial species in Swedish forestry, but they are affected by several damaging fungal pathogens (some introduced, some native), and more are spreading throughout Europe. For example, several pine needle pathogens like species of Dothistroma, Lophodermium, Lophodermella and recently, aggressive fungal pathogens like Diplodia sapinea and Sydowia polyspora are becoming more and more problematic probably because of climate change which makes conditions more favourable for pathogen development. In addition, changing climate conditions for the host (decreasing vitality due to host stress caused by drought) can also increase the incidence and severity of diseases in the forest. In some cases, this can lead to local outbreaks and after several consecutive years of attack, it can seriously reduce tree growth, wood production and kill trees directly, causing huge economic losses for the forest owner and in some cases, threaten biodiversity and jeopardize the provision of ecosystem services. The most effective way to improve the situation and prevent large-scale outbreaks of forest disease is to strengthen our position to detect problems at an early stage to allow for mitigation measures to be effective. To succeed in these efforts, novel and innovative tools must be developed. To maximize their effect, these tools need to be rapid, simple and portable so that stakeholders (forest owners, managers) can use them in practice. The purpose of this project is to develop and implement a rapid detection tool based on the technology of "Loop-mediated isothermal amplification (LAMP)" – an alternative approach to the current PCR diagnostics that are so time consuming and expensive. The new LAMP assay, fitted to a portable DNA amplification machine, that is user-friendly and field-suitable, makes it possible to be adopted into practice. The project aims to develop and test LAMP-based diagnostic assays for rapid and early detection for these two important pine pathogens that are causing local disease outbreaks in Sweden. The uptake and utilization of this new detection tool in practice will inevitably strengthen Swedish forestry by safeguarding pine forests against new and emerging pathogens. Furthermore, the tools pioneered on pine in this project can be readily applied to other tree and plant systems in the urban green and agricultural sectors that are also affected by plant diseases.