Mikroskopibaserad systembiologisk analys av cellmigration
- Diarienummer
- SB16-0046
- Start- och slutdatum
- 170801-220731
- Beviljat belopp
- 35 000 000 kr
- Förvaltande organisation
- Karolinska Institutet
- Forskningsområde
- Livsvetenskaperna
Summary
Traditionella systembiologiska metoder har begränsad förmåga att inkorporera den komplexitet som tids- och rumsaspekterna medför. Därför behövs metoder för att samla data och bygga modeller i livets 4 dimensioner; 3D-rymd och tid i enskilda levande celler. Huvudsökanden ledde därför nyligen ett EU-nätverk för att utveckla Systemmikroskopi, en ny strategi där automatiserad kvantitativ mikroskopi kombineras med bioinformatik, avancerad statistisk och modellering. Denna strategi kommer att vara central för att bygga förståelse av komplexa molekylära, subcellulära och cellulära nätverk. Projektet fokuserar på cellmigration, en komplex, dynamisk process, viktig under cancerutveckling. Här vidareutvecklas systemmikroskopin genom utveckling och inkorporering av nya detektionsmetoder, som också kombineras på ett unikt sätt med nyliga metoder för expressionsprofilering i enskilda celler. Projektet syftar till att kartlägga den molekylära och cellulära dynamik som styr cancercellers migration. Vi planerar att kommersialisera nya teknologier via de deltagande företagen, Olink Biosciences och Sprint Bioscience, samt att identifiera nya möjliga måltavlor för cancerterapi och söka industrisamarbeten för att omsätta dessa till kliniskt bruk. Genom integrerat multidisciplinärt samarbete mellan ledande svenska forskare så utgör projeket en unik möjlighet för Sverige att bli globalt ledande inom systemmikroskopi och för svensk industri att använda och kommersialisera nya produkter.
Populärvetenskaplig beskrivning
Alla livsprocesser styrs i tid och rum i varje enskild cell. Traditionella systembiologiska metoder har dock en begränsad förmåga att inkorporera den komplexitet som tids- och rumsaspekterna medför. Därför behövs metoder för att samla data och bygga modeller i livets fyra dimensioner; 3D-rymd och tid i enskilda levande celler. Huvudsökanden ledde därför nyligen ett EU-nätverk för att utveckla Systemmikroskopi, en ny strategi där automatiserad kvantitativ mikroskopi kombineras med bioinformatik, avancerad statistisk och modellering. Denna strategi kommer att vara central för att bygga förståelse av komplexa molekylära, subcellulära och cellulära nätverk och hur de samverkar i tid och rum. Projektet fokuserar på cellmigration (cellers förflyttning), en komplex, dynamisk process, som är viktig under cancerutveckling. Här vidareutvecklas systemmikroskopin genom utveckling och inkorporering av nya verktyg och metoder, som också kombineras på ett unikt sätt med nyliga metoder för mätningar av specifika protein- och mRNA-nivåer i enskilda celler. Projektet syftar till att kartlägga den molekylära och cellulära dynamik som styr cancercellers migration. Vi planerar att kommersialisera nya teknologier via de deltagande företagen, Olink Biosciences och Sprint Bioscience, samt att identifiera nya möjliga måltavlor för cancerterapi och söka industrisamarbeten för att omsätta dessa till klinisk användning. Genom integrerat multidisciplinärt samarbete mellan ledande svenska forskare så utgör projeket en unik möjlighet för Sverige att bli globalt ledande inom systemmikroskopi och för svensk industri att använda och kommersialisera nya produkter.