Biobanksbaserad utvärdering av nya test i cervixscreening
- Diarienummer
- RB13-0011
- Start- och slutdatum
- 150101-220331
- Beviljat belopp
- 32 000 000 kr
- Förvaltande organisation
- Karolinska Institutet
- Forskningsområde
- Livsvetenskaperna
Summary
Vi föreslår här en nydanande, snabb, pålitlig och kostnadseffektiv metod för utvärderingen av kliniskt relevanta biomarkörer, genom exploatering av den svenska register- och biobanksinfrastrukturen. Vi kommer att använda en biobank som upprättats enligt högsta vetenskapliga standard, genom insamling av prover från den befolkningsbaserade gynekologiska cellprovskontrollen. Denna biobank länkas till fullständiga register med uppgift om ursprungliga testresultat och kliniska utfall: allvarliga cellförändringar eller cancer i livmoderhalsen. Med samma bas av prover och data kommer vi att validera de kommersiellt tillgängliga testerna samt analysera genetiska markörer, RNA-transkription, och viktiga proteiner. Vi kommer att jämföra huruvida dessa analyser tillför något utöver det prediktiva värdet redan uppnått av de biomarkörer som är tillgängliga på (eller nära) marknaden. På så vis kommer vi att utreda om någon/några, och i så fall vilken/vilka nya biomarkörer som har bättre utfall än de i nuläget etablerade för cervixscreening (molekylärt virustest – HPV test – följt av triage med cytologi). Projektet har en tydlig implementeringsplan kring hur de bästa biomarkörerna sedan ska introduceras i screeningen. Vårt mål är att skräddarsy screeningfrekvensen (hur ofta man får kallelse) till varje individ utifrån hennes biomarkör-bestämda risk. På så sätt kommer vi att kunna förbättra både folkhälsan och svensk konkurrenskraft inom forskning på biomarkörer.
Populärvetenskaplig beskrivning
Vårt projekt syftar till att utveckla ett nytt, snabbare, säkrare och billigare sätt att utvärdera om ett nytt test (biomarkör) skulle kunna förbättra ett kliniskt provtagningsprogram. Som modell använder vi den gynekologiska cellprovskontrollen, ett organiserat program som erbjuds alla svenska kvinnor mellan 23-60 års ålder och som medfört en kraftigt minskad sjuklighet i livmoderhalscancer. På senare år har två stora förändringar införts i detta program. Dels har man börjat använda ett virus-test (HPV-test) istället för att analysera cellprovet genom att titta på cellernas utseende; dels tas provet i en förvaringsvätska som medger att provet kan sparas i många år och ändå senare användas för att analysera både DNA, RNA, proteiner och celler. Utvärdering av biomarkörer görs idag oftast i olika studier som är väldigt kostsamma och där det tar mycket lång tid att följa upp patienterna. Dessutom utvärderas olika tester i olika material och kan då inte jämföras på ett bra sätt. Genom att ta de prover som sparats (i biobanker), och till dem koppla information om vilka kvinnor som fått sjukdom flera år efteråt, kan vi utvärdera hur olika tester fungerar även på lång sikt. Detta är den viktigaste faktorn för att avgöra om ett nytt test medför en förbättrad kostnadseffektivitet (det vill säga huruvida man inte behöver ta testet lika ofta). Vi kommer att utvärdera ett flertal tester som redan finns på marknaden, samtidigt som vi även kommer att leta efter nya biomarkörer (såsom uttryck av gener eller proteiner). Eftersom alla biomarkörer utvärderas med samma prover kan vi avgöra vilka biomarkörer som tillför något mer än andra; och avgöra vilken/vilka som skulle innebära den största förbättringen för cellprovskontrollen. Sverige har internationellt en unik fördel för utveckling av biomarkörer eftersom vi har tillgång till heltäckande biobanker och registerdata. Genom detta projekt hoppas vi dels att kunna förbättra kvinnohälsan, dels visa på de strategiska möjligheter som fördelarna i vår svenska forskningsinfrastruktur medger. Därigenom stärker vi både svensk konkurrenskraft och folkhälsan i allmänhet.