Dynamiskt beteende hos protein-DNA interaktioner
- Diarienummer
- I06-0240
- Start- och slutdatum
- 070901-121231
- Beviljat belopp
- 3 000 000 kr
- Förvaltande organisation
- Göteborg University
- Forskningsområde
- Bioteknik, medicinsk teknik och teknik för livsvetenskaperna
Summary
DNA är den molekyl som bär information om organismers uppbyggnad. För att möjliggöra att DNA-koden översätts till proteinstruktur på rätt sätt har en mängd olika proteiner som uppift att binda till DNA för att bla. tala om när olika gener behövs. Samtidigt är DNA-molekylen utsatt för en mängd olika substanser som kan skada densamma. DNAt måste därför vara skyddat av ett maskineri som har till uppgift att laga DNA när ett brott har skett. Dessa procedurer har gemensamt att de på olika sätt involverar protein-DNA interaktioner. Dessa DNA-protein interaktioner studeras idag på diverse olika sätt varav de flesta är sk. ensemble-metoder vilket betyder att man får ett medelvärde av en mängd olika interaktioner. Senare tids utveckling på känsliga fysikaliska mätmetoder har dock möjliggjort denna typ av forskning på färre och enstaka molekyler. Detta betyder att en mängd fenomen som tidigare bara kunnat studeras indirekt nu kan både studeras med dessa nya tekniker. Några sådana fenomen är förflyttning och diffusion längs med DNA och hur protein hitter specifika DNA-sekvenser. Jag vill med hjälp av detta forskningsbidrag bygga upp en verktygsarsenal med optisk pinsett (enstaka molekyler), QCM-D (få molekyler) och ensemble-metoder där denna typ av frågeställningar kan studeras. Med dessa metoder blir det lättare att bygga upp en fullständigt bild av dessa DNA-protein interaktioner och på så sätt få förståelse för hur vissa sjukdomar såsom cancer och diabetes kan uppstå.