Ett integrerad perspektiv på embryonalutveckling i mammalier
- Diarienummer
- I06-0248
- Start- och slutdatum
- 070901-101231
- Beviljat belopp
- 3 000 000 kr
- Förvaltande organisation
- Karolinska Institutet
- Forskningsområde
- Bioteknik, medicinsk teknik och teknik för livsvetenskaperna
Summary
Att studera embryonala stamceller (ES) är viktigt för både grundforskning och humanmedicin. Det långsiktiga målet med denna forskningsplan är att fördjupa vår kunskap om de molekylära processer som reglerar symmetrisk celldelning och differentiering under embryonal utveckling. Mer specifikt ämnar vi studera den transkriptionella och post-transkriptionella reglering i odifferentierade ES cell linjer och i tidiga differentieringstadier med hjälp av att utveckla ny array- och sekvens-baserad metodik. Vi vill mäta utrycksnivåer av alla transkriberade regioner och utveckla algorithmer som kan uppskatta vilka specificka protein- och icke-kodande transkript (t.ex. splitsvarianter) som uttrycks i de olika utvecklingsstadierna. Vi ämnar också utveckla ett nytt protokoll som möjliggör samma högupplösta analys av RNA populationen ifrån enskilda celler. På längre sikt är målet att integrera olika data på genregleringsmekanismer från vår grupp och andra grupper för att etablera en mer övergripande modell av molekylär reglering i ES celler. Vi vill också jämföra data från in vitro differentiering med in vivo differentiering för att om möjligt identifiera faktorer som kan förbättra protokollen för in vitro differentiering och slutligen humanmedicin.