'Chemical biology' studier av protein-lipid interaktioner
- Diarienummer
- MDB09-0010
- Start- och slutdatum
- 090801-131231
- Beviljat belopp
- 2 100 000 kr
- Förvaltande organisation
- Stockholm University
- Forskningsområde
- Livsvetenskaperna
Summary
Projektet syftar till att kombinera (i) ett in vitro transkriptions/translationssystem utvecklat av den svenska partnern som gör det möjligt att mäta interaktionsenergin mellan aminosyror i en transmembran alfahelix och det endoplasmatiska nätverkets membran, med (ii) den nya Flexizyme-tekniken utvecklad av den japanska partnern som gör det möjligt att ladda en suppressor-tRNA med en i det närmaste obegränsad variation av syntetiska aminosyror. Suppressor-tRNA molekylen kan användas för att introducera den syntetiska aminosyran i en godtyckligt vald position i transmembranhelixen, och aminosyrans interaktionsenergi med membranet kan på så sätt mätas upp under ‘biologiska’ betingelser. I projektet kommer vi att studera ett stort antal syntetiska aminosyror för att utveckla en fragmentbaserad fri-energiskala som beskriver membranaffiniteten hos olika molekylära grupper som typiskt ingår i läkemedel och som kan belysa de molekylära interaktionerna mellan biomolekyler av olika slag och ett biologiskt membran.
Populärvetenskaplig beskrivning
Projektet syftar till att kombinera tekniker utvecklade av den svenska respektive japanska partnern för att studera hur olika slags molekyler binder till biologiska membran. Projektet har relevans för både läkemedelsutveckling och biologisk grundforskning.