Analys av flera gener i ett flertal enskilda celler
- Diarienummer
- MDB09-0052
- Start- och slutdatum
- 090801-120831
- Beviljat belopp
- 2 100 000 kr
- Förvaltande organisation
- Karolinska Institutet
- Forskningsområde
- Bioteknik, medicinsk teknik och teknik för livsvetenskaperna
Summary
Utvecklingen inom biovetenskaperna har varit enorm de senaste 20 åren. HUGO-projektet bidrog till den utvecklingen och skapade nya metoder för att förstå biologiska fenomen, med hjälp av stora datamängder. Dock kan nuvarande metoder endast mäta populations-genomsnitt. Men eftersom organismer består av miljoner celler, och cellen är den funktionella enheten, behövs metoder att studera enskilda celler både snabbt och billigt. Här fokuserar vi på kvantitativ analys av mRNA i enskilda celler. Efterfrågan på att analysera mRNA i enskilda celler växer snabbt. Vi kommer därför samarbeta för att utveckla (1) en robust och reproducerbar metod för att mäta hela transkriptom i hundratals enskilda celler, och (2) en billig metod att analysera tiotals eller hundratals mRNA i ett stort antal enskilda celler. Den första metoden blir dyr, men ger fullständiga dataset som kan anvädnas för att välja ut specifika markörgener. Den andra metoden blir billigare och kan sedan användas för att övervaka de utvalda markörerna i specifika sjukdomsvävnader.
Populärvetenskaplig beskrivning
Människokroppen är uppbyggd av celler, och cellen är den funktionella enheten i alla vävnader och organ. Därför är det av yttersta vikt att kunna följa biologiska och medicinska förlopp i enskilda celler. Eftersom alla människans vävnader är komplexa, är det viktigt att kunna göra mätningar inte bara på ett fåtal celler, utan på tusentals. Vi vill därför samarbeta för att utveckla nya metoder att studera genaktivitet i enskilda celler. Genom att kombinera den molekylärbiologiska expertisen i den svenska gruppen, med ingenjörskunskapen hos den japanska, kan vi nå en kritisk massa som kan leda till radikalt förbättrade analysmetoder. I förlängningen kommer dessa metoder leda till fördjupad förståelse av mänsklliga sjukdomar och andra biologiska fenomen, och därmed till förbättrad hälsa och minskat lidande.