Vävnadsbaserade realtidsanalyser
- Diarienummer
- SM07-0017
- Start- och slutdatum
- 080101-100630
- Beviljat belopp
- 660 000 kr
- Förvaltande organisation
- Uppsala University
- Forskningsområde
- Bioteknik, medicinsk teknik och teknik för livsvetenskaperna
Summary
Projektet avser att utveckla nya verktyg för realtidsanalys av molekylära interaktioner i vävnadssnitt. Detta kommer att erbjuda möjligheter att klassa cancerpatienter baserat på skillnader i molekylära egenskaper och mängd måltavlor i vävnaden. Då de flesta cellbaserade analyser som används idag är utvärderingar av statiska förhållanden är mekanismerna bakom de dynamiska biologiska förloppen mindre kända. Ridgeview Instruments AB utvecklar LigandTracer som är ett halvautomatiskt instrument för realtidsanalyser av protein-cellinteraktioner hos odlade celler. Målet i det sökta projektet är att ersätta de odlade cellerna med vävnad: förena klassisk histologi med teknologi för realtidsdetektion och därmed få tidsupplösningen i det histologiska utvärderandet. Den nuvarande LigandTracer-familjen modifieras för att fungera med vävnad och benämns TissueTracer. I ett första steg kommer TissueTracer att användas för utvecklandet av IHC analyser. Detta för att erhålla kunskap och etablera en stark länk till specialister i Human Protein Atlas projektet. Senare kommer vävnad från 50 coloncancerpatienter karaktäriseras med TissueTracer och resultatet kommer att jämföras med resultat erhållna från klassiska metoder. Då Ridgeview Instruments saknar erfarenhet och material rekryteras ett interdisciplinärt projektteam. Om finansiering erhålls kommer den sökande att vara en del av detta team som ansvarig för utvecklingen och validering av vävnads-assay.
Populärvetenskaplig beskrivning
Ett problem vid traditionell analys av vävnadssnitt är att de inte ger en kvantitativ bild av proteinuttryck i cellerna. Genom att vidareutveckla ett befintligt instrument, framtaget för att analysera proteinuttryck i odlade celler, så vill vi i vävnadssnitt kunna studera interaktioner mellan molekyler, både kvantitativt och med god tidsupplösning. Vi kommer i projektet att på vävnad från cancerpatienter jämföra resultat erhållna med det nyutvecklade instrumentet och resultat från konventionella metoder som immunohistokemi. Utvecklandet kan ha positiva konsekvenser vid framtida analyser av vävnadsmaterial från patienter då en mer individualiserad behandling möjliggörs.